Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VNN3Q9NY84 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms