Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TBCCD1Q9NVR7 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TBCCD1Q9NVR7 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TBCCD1Q9NVR7 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TBCCD1Q9NVR7 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TBCCD1Q9NVR7 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TBCCD1Q9NVR7 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TBCCD1Q9NVR7 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms