Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms