Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ASCL3Q9NQ33 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms