Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD15

SRA1, Steroid receptor RNA activator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRA1Q9HD15 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SRA1Q9HD15 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRA1Q9HD15 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRA1Q9HD15 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRA1Q9HD15 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRA1Q9HD15 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRA1Q9HD15 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRA1Q9HD15 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRA1Q9HD15 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRA1Q9HD15 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SRA1Q9HD15 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRA1Q9HD15 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRA1Q9HD15 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRA1Q9HD15 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRA1Q9HD15 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SRA1Q9HD15 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRA1Q9HD15 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRA1Q9HD15 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRA1Q9HD15 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRA1Q9HD15 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRA1Q9HD15 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRA1Q9HD15 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRA1Q9HD15 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRA1Q9HD15 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRA1Q9HD15 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRA1Q9HD15 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRA1Q9HD15 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRA1Q9HD15 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRA1Q9HD15 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRA1Q9HD15 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRA1Q9HD15 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRA1Q9HD15 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRA1Q9HD15 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRA1Q9HD15 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRA1Q9HD15 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRA1Q9HD15 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRA1Q9HD15 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRA1Q9HD15 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SRA1Q9HD15 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRA1Q9HD15 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRA1Q9HD15 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SRA1Q9HD15 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRA1Q9HD15 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRA1Q9HD15 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRA1Q9HD15 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRA1Q9HD15 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRA1Q9HD15 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRA1Q9HD15 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRA1Q9HD15 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRA1Q9HD15 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRA1Q9HD15 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRA1Q9HD15 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRA1Q9HD15 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRA1Q9HD15 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRA1Q9HD15 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRA1Q9HD15 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRA1Q9HD15 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRA1Q9HD15 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRA1Q9HD15 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRA1Q9HD15 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRA1Q9HD15 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRA1Q9HD15 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRA1Q9HD15 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRA1Q9HD15 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRA1Q9HD15 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRA1Q9HD15 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRA1Q9HD15 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRA1Q9HD15 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRA1Q9HD15 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRA1Q9HD15 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRA1Q9HD15 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRA1Q9HD15 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms