Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL4Q9C0H6 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms