Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEMA4CQ9C0C4 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SEMA4CQ9C0C4 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms