Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SNHG12Q9BXW3 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SNHG12Q9BXW3 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms