Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP1Q9BPW8 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms