Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms