Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RGPD5Q99666 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms