Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNBD2Q96M20 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms