Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NMD3Q96D46 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms