Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD2Q96BF3 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMIGD2Q96BF3 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms