Protein–RNA interactions for Protein: Q96AY2

EME1, Crossover junction endonuclease EME1, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME1Q96AY2 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EME1Q96AY2 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms