Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SVOPQ8N4V2 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms