Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX29P2Q8IUI4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX29P2Q8IUI4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX29P2Q8IUI4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX29P2Q8IUI4 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX29P2Q8IUI4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX29P2Q8IUI4 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX29P2Q8IUI4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX29P2Q8IUI4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX29P2Q8IUI4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX29P2Q8IUI4 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX29P2Q8IUI4 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX29P2Q8IUI4 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX29P2Q8IUI4 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX29P2Q8IUI4 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX29P2Q8IUI4 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX29P2Q8IUI4 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX29P2Q8IUI4 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX29P2Q8IUI4 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX29P2Q8IUI4 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX29P2Q8IUI4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms