Protein–RNA interactions for Protein: Q6W0C5

DPPA3, Developmental pluripotency-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPPA3Q6W0C5 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
DPPA3Q6W0C5 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms