Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRNP1Q6NT89 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms