Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LRRC8EQ6NSJ5 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LRRC8EQ6NSJ5 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms