Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf135Q5VTT2 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms