Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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C10orf55Q5SWW7 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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C10orf55Q5SWW7 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
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C10orf55Q5SWW7 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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C10orf55Q5SWW7 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C10orf55Q5SWW7 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C10orf55Q5SWW7 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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