Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC27A3Q5K4L6 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms