Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL40Q2TBA0 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL40Q2TBA0 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms