Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SIX1Q15475 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
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