Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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NECTIN1Q15223 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NECTIN1Q15223 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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