Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
GAPVD1Q14C86 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GAPVD1Q14C86 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms