Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BECN1Q14457 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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