Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DDX39BQ13838 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms