Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ALCAMQ13740 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALCAMQ13740 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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