Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CUL1Q13616 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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