Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
IFT88Q13099 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IFT88Q13099 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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