Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLFN5Q08AF3 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms