Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPN12Q05209 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms