Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
CDK5Q00535 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK5Q00535 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms