Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HBBP68871 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HBBP68871 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HBBP68871 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HBBP68871 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HBBP68871 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HBBP68871 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HBBP68871 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HBBP68871 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HBBP68871 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HBBP68871 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HBBP68871 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HBBP68871 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HBBP68871 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HBBP68871 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HBBP68871 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HBBP68871 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HBBP68871 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
HBBP68871 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HBBP68871 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HBBP68871 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
HBBP68871 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HBBP68871 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
HBBP68871 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HBBP68871 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HBBP68871 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
HBBP68871 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HBBP68871 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HBBP68871 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HBBP68871 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
HBBP68871 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HBBP68871 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HBBP68871 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HBBP68871 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HBBP68871 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HBBP68871 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HBBP68871 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HBBP68871 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HBBP68871 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HBBP68871 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HBBP68871 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HBBP68871 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HBBP68871 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HBBP68871 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HBBP68871 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HBBP68871 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HBBP68871 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
HBBP68871 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HBBP68871 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HBBP68871 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
HBBP68871 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HBBP68871 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HBBP68871 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HBBP68871 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HBBP68871 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HBBP68871 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HBBP68871 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HBBP68871 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HBBP68871 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HBBP68871 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HBBP68871 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HBBP68871 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HBBP68871 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HBBP68871 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HBBP68871 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HBBP68871 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HBBP68871 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HBBP68871 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HBBP68871 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HBBP68871 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HBBP68871 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HBBP68871 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HBBP68871 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HBBP68871 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HBBP68871 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
HBBP68871 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HBBP68871 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HBBP68871 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HBBP68871 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HBBP68871 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HBBP68871 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HBBP68871 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HBBP68871 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HBBP68871 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HBBP68871 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HBBP68871 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HBBP68871 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HBBP68871 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HBBP68871 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HBBP68871 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HBBP68871 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
HBBP68871 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HBBP68871 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HBBP68871 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HBBP68871 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HBBP68871 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HBBP68871 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HBBP68871 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HBBP68871 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HBBP68871 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms