Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RPS3AP61247 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms