Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RAD23AP54725 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms