Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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PGGT1BP53609 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PGGT1BP53609 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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