Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCR4P51679 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCR4P51679 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCR4P51679 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCR4P51679 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCR4P51679 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCR4P51679 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR4P51679 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR4P51679 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR4P51679 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR4P51679 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR4P51679 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR4P51679 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR4P51679 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR4P51679 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR4P51679 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR4P51679 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR4P51679 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR4P51679 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR4P51679 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR4P51679 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR4P51679 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR4P51679 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR4P51679 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR4P51679 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR4P51679 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR4P51679 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR4P51679 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR4P51679 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR4P51679 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR4P51679 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR4P51679 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR4P51679 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR4P51679 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR4P51679 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR4P51679 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR4P51679 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR4P51679 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR4P51679 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR4P51679 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR4P51679 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR4P51679 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR4P51679 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR4P51679 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR4P51679 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR4P51679 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR4P51679 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR4P51679 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR4P51679 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR4P51679 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR4P51679 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR4P51679 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR4P51679 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR4P51679 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR4P51679 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR4P51679 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR4P51679 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR4P51679 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR4P51679 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR4P51679 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR4P51679 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR4P51679 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR4P51679 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR4P51679 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR4P51679 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR4P51679 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR4P51679 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR4P51679 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR4P51679 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR4P51679 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR4P51679 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR4P51679 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR4P51679 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR4P51679 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR4P51679 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR4P51679 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR4P51679 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR4P51679 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR4P51679 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR4P51679 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR4P51679 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCR4P51679 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCR4P51679 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCR4P51679 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCR4P51679 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCR4P51679 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCR4P51679 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCR4P51679 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCR4P51679 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCR4P51679 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCR4P51679 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCR4P51679 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCR4P51679 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCR4P51679 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCR4P51679 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCR4P51679 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCR4P51679 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCR4P51679 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCR4P51679 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCR4P51679 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms