Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RAB5CP51148 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms