Protein–RNA interactions for Protein: P43351

RAD52, DNA repair protein RAD52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD52P43351 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD52P43351 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD52P43351 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD52P43351 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD52P43351 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD52P43351 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD52P43351 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD52P43351 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD52P43351 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD52P43351 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD52P43351 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD52P43351 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD52P43351 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD52P43351 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD52P43351 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD52P43351 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD52P43351 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD52P43351 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD52P43351 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD52P43351 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD52P43351 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD52P43351 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD52P43351 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD52P43351 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD52P43351 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD52P43351 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD52P43351 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD52P43351 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD52P43351 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD52P43351 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD52P43351 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD52P43351 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD52P43351 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD52P43351 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD52P43351 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD52P43351 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD52P43351 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD52P43351 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD52P43351 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD52P43351 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD52P43351 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD52P43351 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD52P43351 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD52P43351 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD52P43351 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD52P43351 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD52P43351 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD52P43351 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD52P43351 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD52P43351 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD52P43351 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD52P43351 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD52P43351 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD52P43351 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD52P43351 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD52P43351 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD52P43351 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD52P43351 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD52P43351 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD52P43351 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD52P43351 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD52P43351 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD52P43351 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAD52P43351 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAD52P43351 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAD52P43351 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAD52P43351 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAD52P43351 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAD52P43351 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAD52P43351 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAD52P43351 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAD52P43351 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAD52P43351 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAD52P43351 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD52P43351 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD52P43351 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD52P43351 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD52P43351 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD52P43351 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD52P43351 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD52P43351 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD52P43351 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD52P43351 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD52P43351 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD52P43351 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD52P43351 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD52P43351 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD52P43351 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD52P43351 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD52P43351 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD52P43351 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD52P43351 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD52P43351 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD52P43351 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD52P43351 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD52P43351 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD52P43351 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD52P43351 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD52P43351 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD52P43351 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms