Protein–RNA interactions for Protein: P35712

SOX6, Transcription factor SOX-6, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX6P35712 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX6P35712 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX6P35712 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX6P35712 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX6P35712 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX6P35712 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX6P35712 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX6P35712 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX6P35712 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX6P35712 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX6P35712 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX6P35712 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX6P35712 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX6P35712 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX6P35712 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX6P35712 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX6P35712 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX6P35712 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX6P35712 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX6P35712 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX6P35712 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX6P35712 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX6P35712 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX6P35712 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX6P35712 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX6P35712 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX6P35712 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX6P35712 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX6P35712 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX6P35712 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX6P35712 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX6P35712 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX6P35712 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX6P35712 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX6P35712 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX6P35712 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX6P35712 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX6P35712 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX6P35712 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX6P35712 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX6P35712 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX6P35712 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX6P35712 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX6P35712 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX6P35712 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX6P35712 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX6P35712 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX6P35712 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOX6P35712 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX6P35712 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX6P35712 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX6P35712 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX6P35712 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX6P35712 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX6P35712 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX6P35712 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX6P35712 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX6P35712 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX6P35712 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX6P35712 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX6P35712 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX6P35712 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX6P35712 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX6P35712 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX6P35712 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX6P35712 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX6P35712 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX6P35712 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX6P35712 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX6P35712 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX6P35712 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX6P35712 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX6P35712 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX6P35712 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX6P35712 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX6P35712 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX6P35712 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX6P35712 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX6P35712 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX6P35712 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX6P35712 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX6P35712 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SOX6P35712 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX6P35712 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX6P35712 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX6P35712 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX6P35712 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX6P35712 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX6P35712 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX6P35712 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX6P35712 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX6P35712 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX6P35712 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX6P35712 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX6P35712 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX6P35712 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX6P35712 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX6P35712 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX6P35712 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SOX6P35712 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms