Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD40LGP29965 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD40LGP29965 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms