Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNB1P11230 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms