Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR2F1P10589 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms