Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GLI3P10071 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GLI3P10071 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GLI3P10071 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GLI3P10071 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GLI3P10071 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GLI3P10071 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GLI3P10071 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GLI3P10071 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GLI3P10071 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GLI3P10071 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GLI3P10071 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GLI3P10071 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GLI3P10071 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GLI3P10071 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GLI3P10071 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GLI3P10071 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GLI3P10071 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GLI3P10071 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GLI3P10071 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GLI3P10071 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GLI3P10071 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GLI3P10071 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GLI3P10071 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GLI3P10071 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GLI3P10071 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GLI3P10071 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GLI3P10071 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GLI3P10071 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GLI3P10071 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GLI3P10071 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GLI3P10071 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GLI3P10071 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GLI3P10071 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GLI3P10071 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GLI3P10071 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GLI3P10071 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GLI3P10071 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GLI3P10071 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLI3P10071 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLI3P10071 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLI3P10071 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GLI3P10071 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLI3P10071 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLI3P10071 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GLI3P10071 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GLI3P10071 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLI3P10071 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLI3P10071 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLI3P10071 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLI3P10071 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLI3P10071 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLI3P10071 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLI3P10071 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLI3P10071 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLI3P10071 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLI3P10071 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLI3P10071 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLI3P10071 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLI3P10071 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLI3P10071 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLI3P10071 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLI3P10071 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLI3P10071 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLI3P10071 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLI3P10071 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLI3P10071 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GLI3P10071 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLI3P10071 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GLI3P10071 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLI3P10071 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GLI3P10071 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLI3P10071 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GLI3P10071 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLI3P10071 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLI3P10071 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GLI3P10071 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
GLI3P10071 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GLI3P10071 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GLI3P10071 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GLI3P10071 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GLI3P10071 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GLI3P10071 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GLI3P10071 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GLI3P10071 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GLI3P10071 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GLI3P10071 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GLI3P10071 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GLI3P10071 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GLI3P10071 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GLI3P10071 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLI3P10071 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLI3P10071 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLI3P10071 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLI3P10071 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLI3P10071 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLI3P10071 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLI3P10071 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLI3P10071 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLI3P10071 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms