Protein–RNA interactions for Protein: P06493

CDK1, Cyclin-dependent kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK1P06493 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK1P06493 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK1P06493 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK1P06493 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK1P06493 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK1P06493 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK1P06493 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK1P06493 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK1P06493 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK1P06493 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK1P06493 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK1P06493 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK1P06493 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK1P06493 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK1P06493 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK1P06493 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK1P06493 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK1P06493 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK1P06493 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK1P06493 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK1P06493 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK1P06493 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK1P06493 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK1P06493 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK1P06493 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK1P06493 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK1P06493 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK1P06493 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK1P06493 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK1P06493 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK1P06493 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK1P06493 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK1P06493 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK1P06493 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK1P06493 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK1P06493 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK1P06493 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK1P06493 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK1P06493 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK1P06493 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK1P06493 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK1P06493 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK1P06493 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK1P06493 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK1P06493 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK1P06493 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK1P06493 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK1P06493 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK1P06493 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK1P06493 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK1P06493 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK1P06493 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK1P06493 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK1P06493 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK1P06493 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK1P06493 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK1P06493 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK1P06493 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK1P06493 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK1P06493 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK1P06493 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK1P06493 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK1P06493 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK1P06493 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK1P06493 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK1P06493 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK1P06493 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK1P06493 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK1P06493 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK1P06493 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK1P06493 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK1P06493 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK1P06493 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK1P06493 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK1P06493 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK1P06493 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK1P06493 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK1P06493 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK1P06493 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK1P06493 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK1P06493 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK1P06493 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK1P06493 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK1P06493 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK1P06493 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK1P06493 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK1P06493 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK1P06493 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK1P06493 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK1P06493 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK1P06493 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK1P06493 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK1P06493 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK1P06493 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK1P06493 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK1P06493 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK1P06493 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK1P06493 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK1P06493 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK1P06493 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms