Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SKAP2O75563 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKAP2O75563 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms