Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NEDD8-MDP1E9PL57 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms